Tesis:
Caracterización de razas genéticas del potyvirus Y de la patata. Aplicaciones taxonómicas y epidemiológicas
- Autor: BLANCO URGOITI, Begoña
- Título: Caracterización de razas genéticas del potyvirus Y de la patata. Aplicaciones taxonómicas y epidemiológicas
- Fecha: 1998
- Materia: CIENCIAS AGRONOMICAS. Teseo;FITOPATOLOGIA AGRICOLA. Teseo;VIRUS DE LAS PLANTAS. Teseo
- Escuela: E.T.S. DE INGENIEROS AGRONOMOS
- Departamentos: BIOTECNOLOGIA
- Acceso electrónico:
- Director/a 1º: PONZ ASCASO, Fernando
- Resumen: Se ha desarrollado un método para calcular distancias genéticas entre aislados del potyvirus Y de la patata (PVY), basado en inmunocaptura del virus a partir de un extracto vegetal seguida de transcripción inversa y PCR del gen de la proteína de la cápsida. El fragmento amplificado se somete a digestión con cinco enzimas de restricción y los patrones obtenidos se transforman en matrices de ceros y unos con las que se calculan distancias genéticas. Se ha probado que éstas distancias genéticas son proporcionales a las obtenidas directamente de las secuencias y que, por tanto las distancias genéticas derivadas de patrones de restricción pueden ser utilizadas para agrupar aislados de PVY en cepas genéticas. Utilizando este método se han caracterizado aislados de PVY procedentes de distintos huéspedes y se ha llegado a la conclusión que existen cinco cepas o razas genéticas dentro de este virus: PVYo, PVYn, PVYnp, PVYc2 y PVYluel. Esta clasificación es independiente del huésped del que procede el aislado viral. Se ha probado la aplicación práctica de este método para estudios de variabilidad y epidemiología en muestras de campo de patata de siembra de Álava. Se ha puesto a punto un método de amplificación del genoma de PVY en dos mitades solapantes a partir de virus inmunocapturado en placa con el que se pueden estudiar parecidos genéticos en zonas mayores del genoma viral